Tento druh, který dorůstá do délky ne více než 2 m, je podstatně menší než tuponosý šestižaberní (Hexanchus griseus) a velkooký šestižaberní (Hexanchus nakamurai), který může dorůst až 4.5 m.
Většina druhů žraloků má pět žáber, ale kromě dalšího orgánu má šest žáber také pilovité spodní zuby.
Přečtěte si také: 4 potápěči si užívají vzácné setkání se žralokem šestižábrovým
Předchozí zmatek a chybná identifikace šestižaberních žraloků, zejména velkookého, byla rozptýlena studiem 1310 párů bází dvou mitochondriálních genů, říkají autoři studie publikované v Marine Biodiversity.
Vědci z Florida Institute of Technology, MarAlliance (Belize), Florida State University Coastal & Marine Laboratory a US National Marine Fisheries Service tvrdí, že ačkoliv atlantické šestižaberky vypadají jako ty nalezené v Pacifiku (kolem Japonska) a v Indii. Ocean (Réunion a Madagaskar), jsou geneticky tak odlišní, jako je tuponosá šestižaberní od velkookého.